Lo schema della Basilica è quello classico a croce latina, con tre absidi, coperta con volte a crociera costolonata di impostazione ancora gotica. La navata centrale perviene ad uno splendido presbiterio affiancato da due cappelle e le due navate laterali ospitano sei cappelle ciascuna. I contrafforti, sia in facciata sia sui fianchi, si assottigliano e si rivelano predisposti a concludersi con guglie.
A: cappella di San Benedetto
B: presbiterio
C: cappella di San Martino
Sinistra:
1s: prima cappella (di San Maiolo)
2s: seconda cappella (presentazione Gesù al tempio)
3s: terza cappella (dell'Immacolata)
4s: quarta cappella (di Sant'Antonio abate)
5s: quinta cappella (di Santa Adelaide)
6s: sesta cappella
Destra:
1d: prima cappella
2d: seconda cappella (deposizione di Gesù dalla croce)
3d: terza cappella (del Sacro Cuore)
4d: quarta cappella (morte di San Francesco)
5d: quinta cappella (di San Mauro)
6d: sesta cappella